DNA测序(基因组测序)与RNA测序

DNA测序(基因组测序)与RNA测序首先基因组测序产生 reads 然后对 reads 进行组装产生长片段 Contigs 再确定 Contig 的方向和顺序 组装产生更长的片段 Scaffolds 最后再组装连接 Scaffold 得到完整的染色体序列

大家好,欢迎来到IT知识分享网。

1、DNA测序,基因组测序,即整个基因组都测,不管转录不转录,通常用于基因组组装,重测序进行。

内容摘录自

经典:基因组测序数据从头拼接或组装算法的原理_wangchuang2017的博客-CSDN博客_基因测序算法

基因组组装

首先基因组测序产生reads,然后对reads进行组装产生长片段Contigs,再确定Contig的方向和顺序,组装产生更长的片段Scaffolds,最后再组装连接Scaffold得到完整的染色体序列。

2、RNA测序也就是所谓的RNA-seq,通常指的是转录组测序,只测细胞中的转录本.只有基因组中被转录出来的那部分能测到.通常用于寻找差异表达基因

可参考

RNA-seq数据分析 00:专栏内容介绍及导航 – 知乎

RNA-seq数据构成原理_生信爱好者的博客-CSDN博客_rna-seq测序原理

【基因组组装与转录本组装异同】

知识中心 – 北京概普生物科技有限公司(GapTech)

免责声明:本站所有文章内容,图片,视频等均是来源于用户投稿和互联网及文摘转载整编而成,不代表本站观点,不承担相关法律责任。其著作权各归其原作者或其出版社所有。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容,侵犯到您的权益,请在线联系站长,一经查实,本站将立刻删除。 本文来自网络,若有侵权,请联系删除,如若转载,请注明出处:https://yundeesoft.com/157759.html

(0)
上一篇 2025-01-28 17:10
下一篇 2025-01-28 17:15

相关推荐

发表回复

您的邮箱地址不会被公开。 必填项已用 * 标注

关注微信