Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」

Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」背景:Graph的特征提取方法有很多种,有空域的方法vertexdomain,谱方法spectraldomain,最经典的就是图卷积GCN(GraphConvolutionalNetwork)GCN(GraphConvolutionalNetwork)图卷积网络解析。这里是另一种方法,谱聚类的方法(spectralclustering)。相关论文详解:GCN(Gra…

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背景:Graph的特征提取方法有很多种,有空域的方法vertex domain,谱方法spectral domain,最经典的就是图卷积GCN(Graph Convolutional Network)GCN (Graph Convolutional Network) 图卷积网络解析 。这里是另一种方法,谱聚类的方法( spectral clustering)。

相关论文详解:

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Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解

目录

一、问题描述

1.1 无向图及其矩阵

图的特征提取方法

1.2 切图(节点分类)

1.3 分割后cut(cost)

1.4 另两种切图cut

直接cut的缺点

RatioCut与Ncut

二、相似度矩阵

2.1 相似度矩阵

2.2  ε-近邻法(ε-neighborhood graph)

2.3   k近邻法(k-nearest nerghbor graph)

2.4   全连接法(fully connected graph)

三、切图方法理论推导

3.1 最小化Ratio Cut

3.2 指引向量H

3.3 结论

3.4 Ncut 同理

四、算法流程

4.1 输入输出

4.2 流程

参考


一、问题描述

https://blog.csdn.net/songbinxu/article/details/80838865

聚类属于无监督学习,这个相当于将聚类的方法用到Graph上。因为不是欧几里得空间里面处理数据,所以需要用到Graph的知识来进行聚类。

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1.1 无向图及其矩阵

针对,无向图,带权重图像

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拉普拉斯矩阵:

关于拉普拉斯矩阵与图的关系,可以参见:GCN (Graph Convolutional Network) 图卷积网络解析

对于图 G=(V,E),其Laplacian 矩阵的定义为 L=D-A ,

  • L为拉普拉斯矩阵Laplacian matrix
  • D为对角度矩阵Degree matrix,对角线上的元素是顶点的度,即该元素链接的元素的个数
  • A为邻接矩阵 Adjacency matrix ,即表示任意两个顶点之间的邻接关系,邻接则为1,不邻接则为0

权重矩阵:

每一条边上的权重wij为两个顶点的相似度,从而可以定义相似度矩阵W,这个矩阵即描述所有节点之间关系的矩阵。类似于邻接矩阵。

图的特征提取方法

空域方法:

vertex domain(spatial domain),很直观,直接用相应顶点连接的neighbors来提取特征。

Learning Convolutional Neural Networks for Graphs  http://proceedings.mlr.press/v48/niepert16.pdf

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频域方法

GCN,GAT的方法,即图卷积网络所采用的方法。

GCN (Graph Convolutional Network) 图卷积网络解析

图注意力网络(GAT) ICLR2018, Graph Attention Network论文详解

普聚类Spectral clustering:

即这篇文章所讲的方法

1.2 切图(节点分类)

也叫图分割,相当于把一个图分成许多个子图。

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一个图G可能有很多个子图Gi(总共k个),子图之间没有交集。但是所有子图并在一起得到图G

简而言之,就是图分割成子图之后,分割不重不漏: Gi∩Gj=∅,且G1∪G2∪…∪Gk=G,

1.3 分割后cut(cost)

根据分割的方法,可以算出一个cost。

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  • Gi与Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」互为补集合
  • C()表示cost函数,Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」表示第i个子图与其补集之间的cost
  • 整个分割的cost表示为所有分割后的子图与其补集合之间cost的和
  • C(G1,G2)表示子图G1和子图G2的cost为两图之间所有节点的w
  • w可以理解为两个节点之间的相似程度,也可以理解成节点间的邻接矩阵,我们后面细细讨论w

这样,我们根据w定义了图的分割的cost,下面我们图的聚类问题,转换为了最小化cost的问题。

也有将上面写成这样的:

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很好理解,与上个公式一样,Ai就是切出来的子图,Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」为其补集,只不过这里多了个1/2

1.4 另两种切图cut

直接cut的缺点

安装上面的cut,容易造成一种现象,会造成将图G切成很多个单点离散的图。就是每个节点切成一个图,切出的子图过多。为什么会这样:

每个子图切成一个类,则Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」需要遍历的m就少,更容易满足最小化cut。

RatioCut与Ncut

显然这样是最快且最能满足那个最小化操作的,但这明显不是想要的结果,所以有了RatioCut和Ncut

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  • 其中|Ai| 为Ai中点的个数,vol(Ai)为Ai中所有边的权重和。
  • 除以这个值相当于对切图每个图的cost做了均衡,避免切割过于细,导致出现一堆节点的情况。
  • 这样加入分母,我们希望cut尽量小,则分母就尽量大,所以就会比第一种cut尽可能的使切割后的子图内多一些节点。

二、相似度矩阵

前面1.3中,定义了每两个节点比如节点i和节点j,之间的相似度wij,这部分就是,关于这个相似度w是如何得到的。

2.1 相似度矩阵

相似度矩阵就是样本点中的任意两个点之间的距离度量,在聚类算法中可以表示为距离近的点它们之间的相似度比较高,而距离较远的点它们的相似度比较低,甚至可以忽略。这里用三种方式表示相似度矩阵:一是ε-近邻法(ε-neighborhood graph),二是k近邻法(k-nearest nerghbor graph),三是全连接法(fully connected graph)

2.2  ε-近邻法(ε-neighborhood graph)

节点i和节点j之间,

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  • sij表示两点间欧氏距离的平方
  • 下标i与j是节点的编号
  • xi与xj是节点上的信号

推算到整个相似度矩阵即:

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  • 大W为相似度矩阵,小w为矩阵中的元素,表示节点间的相似度即上面1.3中w的由来
  • Wij中的第i行第j列元素表示节点i与节点j的相似度wij
  • sij大于阈值ε置为0,即距离太远就表示为不相邻
  • sij小于阈值ε置为ε,即距离较近也表示为距离为ε

这种方法一刀切,会损失较多信息,因此很少采用。

2.3   k近邻法(k-nearest nerghbor graph)

每个样本点比如xi最近的k个点定义为KNN(xi),k近邻法得到的W为:

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或者

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如果一个节点对于另一个节点属于k个最近的节点之内,则用高斯核函数得到两点之间的距离作为w

如果不在k个最临近的节点之内,则设为0

第二种不置零的条件相对第一种更加严格,即两点互为k近邻才不设为0

第一种条件相对宽松,只要一个节点对于另一个节点为k近邻就不用置零

所以第二种得到的W矩阵更容易稀疏

2.4   全连接法(fully connected graph)

径向基函数 (Radial Basis Function 简称 RBF)

直接用高斯核函数作为距离,

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  • 表示样本点之间的相似度w直接用高斯核函数的距离表示
  • σ表示样本点的邻域宽度,σ越大则w越大,即样本点之间的相似度越大
  • 可以参考右图,σ可以看做半径,σ越大则对于同一个点的高度越高即w越大,越相近

依然存在一个问题:对于同样的图,σ是否影响聚类的结果?

σ越大则对于所有样本点的相当于除以了同样的值,则之前算得的距离只是做了相同的变换,那么最终的聚类结果是否一样?

实验得出的结论是,σ变化之后,聚类结果就变了。可能因为高斯核函数是一个非线性的函数,相当于对线性的欧式距离做了一个非线性的映射,因此σ变化之后非线性映射变了,最终优化的结果也会发生改变。

指数函数Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」高斯核函数(径向基函数,即RBF)Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」,非线性的,所以σ变大之后w就会变大。

 

三、切图方法理论推导

问题描述:我们通过上面部分,把Graph Clustering转换为了一个Graph Cut的问题,然后又转换为了最小化cut的问题。

即:最好的聚类方法,就是最小化cut的时候,graph分割成的子集。

3.1 最小化Ratio Cut

我们将切图聚类问题,转换为 Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」

即将图G切为k个子集,Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」,让这k个子集满足最小化 Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」

3.2 指引向量H

为了更好的解决这个问题,我们引入一个概念,指引向量H,指引向量与分割方法是等价的,每个一指引向量表示一种分割方法。这样分割图的问题又等价为求指引向量的问题。

我们引入Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」的指示向量 Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」,其中j为子集的下标,与Graph切割后的每个子集对应。每个hj之中的元素为:

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其中i为样本下标(节点下标),这个指示向量 hj,i 即每个子集与所有节点之间的对应关系,若节点i被分入了子集Aj之中,则hj的第i个元素为Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」,否则为0.整张分割之后的图的指引向量为Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」

若想看具体推导,见:https://blog.csdn.net/yc_1993/article/details/52997074

这样定义之后,经过一系列推导,推导过于繁琐,我们只得出最后简洁的结论。

3.3 结论

推导很复杂,但是结论很简洁,只与指引向量H和拉普拉斯矩阵L有关系:

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即Ratiocut的值为 Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」的迹,即对角线元素的和。

那么最小化Ratiocut的问题转化为求能最小化Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」时候的H

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其中,需要对H进行标准化处理
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聚类的时候,分别对H中的行进行聚类即可,通常是kmeans,也可以是GMM,具体看效果而定。

所以问题的转换是这样的:图聚类——切图——求最小化cut——求最小化cut对应的指引向量H

3.4 Ncut 同理

对于Ncut需要更改的地方就是cut计算的公式分母不一样,问题转换还是一样的,推导过程非常类似:

图聚类——切图——求最小化cut——求最小化cut对应的指引向量H——得到了分类的方法

通过上面,我们将最小化Ratiocut的问题转换为了最小化Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」的问题,然后对于Ncut的情况,可以直接类推一下。

类似的,指示变量为:

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最终

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但是再此基础上,Ncut有一定的特殊性,推导见:https://blog.csdn.net/yc_1993/article/details/52997074

Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」,进一步转化问题:

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可以对F进行标准化:

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之后再对F的行进行kmeans或GMM聚类即可。

四、算法流程

https://www.cnblogs.com/pinard/p/6221564.html

上面第二部分理论推导,问题的转换是这样的:图聚类——切图——求最小化cut——求最小化cut对应的指引向量H

https://blog.csdn.net/yc_1993/article/details/52997074

我们以Ncut为例,最后一步采用k-means聚类,来讲一下算法的流程。

4.1 输入输出

输入为图G=(V,E)

输出为图聚类之后的结果,就是其聚类切割之后的k个不重不漏的子集Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」

4.2 流程

根据输入的相似矩阵的生成方式构建样本的相似矩阵S(表明节点之间的关系,可以理解为节点间的correlation matrix甚至可以理解为adjacency matrix邻接矩阵。)

  • 根据相似矩阵S构建邻接矩阵A,构建度矩阵D
  • 计算出拉普拉斯矩阵L(方法见1.1)
  • 构建标准化后的拉普拉斯矩阵Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」
  • 进行特征值分解,最小的k1个特征值所各自对应的特征向量f
  • 将各自对应的特征向量f组成的矩阵按行标准化,最终组成n×k1维的特征矩阵F(这里我们不知道F是不是等价于上面的指引向量H,也不知道傅立叶变换的基与指引向量之间的关系)
  • 对F中的每一行作为一个k1维的样本,共n个样本,用输入的聚类方法进行聚类,聚类维数为k2
  • 根据聚类结果得到子集Graph特征提取方法:谱聚类(Spectral Clustering)详解「终于解决」

相关论文详解:

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参考

【博客】谱聚类(spectral clustering)原理总结

【博客】谱聚类(spectral clustering)及其实现详解

【博客】谱聚类算法(Spectral Clustering)

【Codes】pspectralclustering

【Paper】Parallel Spectral Clustering in Distributed Systems

【API】sklearn.cluster.SpectralClustering

【Demo】Comparing different clustering algorithms on toy dataset

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