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摘要：

文题释义：

转录组测序：是指利用第2代高通量测序技术进行cDNA测序，全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。

生物信息学：是运用数学和信息学方法阐明和解释海量生物学数据所蕴含的生物学意义的重要手段和工具。

背景：急性脑出血中存在差异表达的基因，这些基因与脑出血发生发展有关。

目的：筛选急性脑出血大鼠模型脑组织中差异表达的基因和关键基因，并采用qPCR进行验证，分析关键基因与脑出血后神经功能、脑组织含水量的关系。

方法：78只SD大鼠随机分为2组：脑出血组大鼠于右侧尾状核部位注射胶原酶构建脑出血模型，假手术组大鼠于相同部位注射等量生理盐水。运用TRIzol法将2组大鼠的脑组织提取出RNA，转录组测序，筛选急性脑出血脑组织的差异表达的基因，经过qPCR验证，分析基因与脑出血后神经功能、脑组织含水量的关系，并结合生物信息学对关键基因进行GO、KEGG功能富集分析。

结果与结论：①筛选出10个关键基因，分别是CXCL8、SERPINE1、TFPI2、CXCR4、GDA、KCNQ5、ERICH3、SCN3B、CACNA1E、CCL20；②脑出血组的关键基因GDA、KCNQ5、ERICH3、SCN3B、CACNA1E含量低于假手术组(P < 0.05)，CXCL8、SERPINE1、TFPI2、CXCR4、CCL20含量高于假手术组(P < 0.05)；③关键基因GDA、KCNQ5、ERICH3、SCN3B、CACNA1E含量与脑组织含水量、神经功能缺损评分正相关(P < 0.05)，CXCL8、SERPINE1、TFPI2、CXCR4、CCL20含量与脑组织含水量、神经功能缺损评分负相关(P < 0.05)；④GO分析显示基因在生物过程差异表达基因主要富集于白细胞趋化性、趋化因子介导的信号通路；细胞组成差异表达基因主要富集于阳离子通道复合物、离子通道复合物；分子功能差异表达基因主要富集于门控通道活动、离子通道活动；⑤KEGG分析示基因集中于TNF信号通路、谷氨酸能突触、GABA能突触；⑥结论：在脑出血中出现差异表达的基因为CXCL8、SERPINE1、TFPI2、CXCR4、GDA、KCNQ5、ERICH3、SCN3B、CACNA1E、CCL20，这些基因与脑出血后脑组织含水量、神经功能相关，这些基因主要富集在细胞组分、结合功能、细胞突起等相关的生物学功能上。

https://orcid.org/0000-0003-1704-6235(高玉广)

中国组织工程研究杂志出版内容重点：组织构建；骨细胞；软骨细胞；细胞培养；成纤维细胞；血管内皮细胞；骨质疏松；组织工程

关键词: 脑出血, 基因, 差异性表达, 神经功能, 脑组织含水量, 生物信息学分析

引用本文：高玉广, 钟 洁, 黄德庆, 马玉娟, 廖煜雄, 刘琦琦. 急性脑出血模型大鼠脑组织中差异表达基因测序的验证及功能分析[J]. 中国组织工程研究, 2024, 28(20): 3182-3189.

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急性脑出血模型大鼠脑组织中差异表达基因测序的验证及功能分析