大家好，欢迎来到IT知识分享网。
尔云间 一个专门做科研的团队
原创 小果 生信果
小伙伴们，大家平时肯定经常接触一些有关富集的分析吧，常见的富集主要有GO富集和KEGG富集分析，就是对基因的功能和所属通路进行分析，富集图的表现形式多种多样，有些小伙伴们可能也没有见过。今天小果就带大家见识见识。
首先看一下比较常见的，气泡图。
这个图小伙伴应该基本都见过，横坐标是基因比例，就是富集在该项上的基因数比总基因数，其实反映的就是富集基因数。纵坐标就是这些项了，同时点的大小也反映了富集在该项上的基因数，富集到的基因越多，这个点就越大，而颜色反映了P值的大小，P值越小，-log10（pvalue）就越大，颜色也就越蓝，注意，这里的蓝只是这个图里的，更多的图是颜色越红越显著，注意看图例就行了。
除了气泡图以外，常见的还有柱状图
这就是常见的柱状图了，GO分为三部分，BP,CC,和MF，这三部分在图中用三种颜色显示出来，而横坐标是-log10（pvalue），这个值越大，P值就越小，也就越显著，但是这个图就显示不出来富集到的基因数了。
上面的图各有优缺点，但它们都有一个共同的缺点，那就是不能显示GO项上富集到了具体哪些基因。
上面这个是圈图，它就能解决这些问题，但基因数和GO项的分类就体现不出来了。
好了，小果今天给大家介绍的就是富集图的主要形式了，小伙伴们有什么问题都可以来和小果分享讨论哟。
推荐阅读
- 独木成林，小果教您用genemania把少量基因做成PPI网络图
- 关系乱如网，其实一眼清，网络图解读
- GEO数据库之GPL文件学习
- 简单使用ICGC数据库进行数据查询与下载
- 快速学习如何确定差异分析阈值来筛选差异基因
关注小果，小果将会持续为你带来更多生信干货哦。
生信果 生信入门、R语言、生信图解读与绘制、软件操作、代码复现、生信硬核知识技能、服务器等原创内容
免责声明：本站所有文章内容,图片，视频等均是来源于用户投稿和互联网及文摘转载整编而成，不代表本站观点，不承担相关法律责任。其著作权各归其原作者或其出版社所有。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容,侵犯到您的权益，请在线联系站长,一经查实,本站将立刻删除。 本文来自网络,若有侵权，请联系删除，如若转载，请注明出处：https://yundeesoft.com/159688.html
