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TargetScan 是一个miRNA 靶基因预测的网站, 包括了 人, 小鼠,果蝇 , 线虫, 斑马鱼 共5个物种的miRNA 靶基因结果,
人 : TargetScanHuman
小鼠 :TargetScanMouse
果蝇:TargetScanFly
线虫:TargetScanWorm
斑马鱼 : TargetScanFish
以human 为例,进行说明,网址如下:
http://www.targetscan.org/vert_71/
最新版本为release 7.1, 2016年6月更新,在该数据库中,提供了多种哺乳动物的miRNA 靶基因预测结果:
1)Human : 人
2) Mouse : 小鼠
3) Rat : 大鼠
4) Cow : 牛
5) Dog : 狗
6) Chicken : 鸡
7) Frog : 青蛙
8) Opossum : 负鼠
9) RHesus : 猕猴
10 ) Chimpanzee : 黑猩猩
对于miRNA 和 转录本结合为位点的保守性,TargetScan 提出来以下几种模型:
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