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摘要:
文题释义:
种植体周围炎:是指种植体周围以软组织感染和周围骨质吸收为特征的炎症性疾病,是造成口腔种植修复失败的常见疾病。
差异基因:是指在RNA水平处在不同环境压力、时间、空间等方面下,表达有显著性差异的基因。通过挖掘某疾病的差异基因,为进一步探索疾病发生发展的潜在分子机制提供理论依据。
背景:种植体周围炎严重影响着口腔种植修复的成功,目前仍然没有有效的治愈方法,其发病机制也尚未阐明。
目的:寻找种植体周围炎发生相关的核心差异表达基因,并进行实验验证。
方法:利用生物信息技术从GEO数据库中筛选种植体周围炎牙龈和健康牙龈的差异表达基因,并对差异基因进行富集分析。利用String数据库构建蛋白互作网络,并使用cytoscape软件筛选关键基因,采用 RT-PCR和免疫组化检测对关键基因C3AR1表达进行验证。采用RT-PCR法检测RAW264.7细胞破骨向分化后C3AR1 mRNA的表达水平。
结果与结论:①将GSE33774数据集中种植体周围炎牙龈和健康牙龈的基因数据行差异分析,得到有意义的上调基因33个,下调基因17个,共50个差异表达基因;GO和KEGG结果显示差异表达基因主要富集在免疫受体活性、C-C趋化因子受体活性功能,以及破骨细胞分化相关信号通路上;②共筛选出C3AR1、CD14、TLR4、CCR1、CYBB和FCGR2A 6个关键基因,RT-PCR、免疫组化实验结果证实,C3AR1在种植体周围炎组织中表达上调,且C3AR1在巨噬细胞破骨向分化后表达上调;③结果显示,C3AR1在种植体周围炎中高表达,可能是种植体周围炎骨质破坏的关键基因。
https://orcid.org/0000-0001-9281-8501(韦雨杏)
中国组织工程研究杂志出版内容重点:生物材料;骨生物材料;口腔生物材料;纳米材料;缓释材料;材料相容性;组织工程
关键词: 种植体周围炎, C3AR1, 生物信息学, 差异表达基因, 关键基因, 单核巨噬细胞, 破骨分化, 骨质破坏
引用本文: 韦雨杏, 董 皓, 韦惠平, 谢 诚, 陀杨娟, 覃 浩, 曹 勇. 种植体周围炎炎性组织差异表达基因的筛选及验证[J]. 中国组织工程研究, 2023, 27(30): 4844-4849.
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种植体周围炎炎性组织差异表达基因的筛选及验证
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